Desoksüribonukleiinhape. Geneetilist informatsiooni kandev polümeer, millest koosnevad geenid. DNA on makromolekul, mis koosneb kahest pikast komplementaarsest desoksüribonukleotiidide ahelast, kus monomeerid on üksteisega seotud fosfodiestersidemega. Ahelad… Read More »DNA (ingl. DNA)
DNA piirkond, kus seostuv valk aktiveerib geeni(d).
Rõngasjate DNA-molekulide (nt. vektorite) koopiaarvu tõus.
Metüülgrupi kõrvaldamine N-alusest.
Inimpopulatsioonides on evolutsiooni kiirus keskmiselt 0,57 nukleotiidi vahetust inimgenoomi kohta aastas.
Sinise lainepikkusega valguse poolt aktiveeritav ensüüm, mis tunneb ära ja kõrvaldab keemilise pöördreaktsiooniga DNA-st näiteks UV-kiirguse toimel moodustunud pürimidiindimeerid. Vt. fotoreaktivatsioon.
Erinevate geenide poolt määratud reparatsiooniensüümid, mis tunnevad ära DNA-s esinevad valed N-alused (oksüdeeritud, alküülitud, hüdroksüülitud või desamiinitud) ning osalevad nende väljavahetamisel.
Bakterite topoisomeraas II, ensüüm, mis katalüüsib DNA negatiivsete superspiraalide teket.
Ensüüm, mis katalüüsib DNA kaksikheeliksi komplementaarsete ahelate lahtikeerdumist.
DNA komplementaarsete ahelate 5´-üksikahelalised otsad. Komplementaarsuse tõttu võivad moodustada rõngasja kaksikahelalise DNA.
DNA ahelate „kokkusulatamine”, üksikahelatest kaksikahelate teke.
Vt. DNA amplifikatsioon.
DNA sünteesi järel skaneeritakse sünteesitud DNA-ahelat DNA polümeraaside 3´ → 5´ eksonukleaasse aktiivsuse tõttu: paardumisvead avastatakse ja 3´-otsast kõrvaldatakse mittepaardunud nukleotiid, s.t. parandatakse viga.
DNA lahtikeerdumine (lahtispiraliseerumine) tagab transkriptsiooni toimumise. Lahtikeerdunud kaksikahelalised siRNA-d ja miRNA-d kaotavad eelistatult ühe RNA-ahela.
Ensüüm, mis katalüüsib DNA kaksikheeliksis olevate nukleotiididevaheliste katkete kovalentset ühendamist.
Vt. reparatsioon.
Ensüüm, mis katalüüsib DNA sünteesi.
Kornbergi e. reparatsiooniline DNA polümeraas.
DNA kordusjärjestuste kopeerimisel DNA polümeraas peatub ning dissotsieerub/reassotsieerub korduvalt. Uuestisünteesitud kordusjärjestustega ahel annab ahelasisesel paardumisel juuksenõelastruktuure, mille komplementaarsete ahelate süntees annab uusi DNA-järjestuste korduskoopiaid (klastri… Read More »DNA polümeraasi libisemine (ingl. DNA polymerase slipping)
Ensüüm, mis katalüüsib lühikeste RNA-ahelate sünteesi, mis on järgnevalt DNA-ahelate sünteesi juuretiseks.
Ensüümid, mis katalüüsivad kahjustatud (muteerunud) DNA parandamist.
Vt. DNA polümeraas.
DNA piirkond, kuhu seostub spetsiifiline valk.
Lühikeste, 2–6-nukleotiidipaariliste järjestuste otsakuti järgnevad (tandeemsed) kordused DNA-molekulis. Nimetatakse ka mikrosatelliitideks.
Mõned restriktaasid tekitavad katked DNA kaksikahelatel samas punktis. DNA mõlemad ahelad on katkekohal võrdse pikkusega, ilma kleepuvate otsteta. Need on nn. tömbid otsad.
Ensüüm, mis põhjustab DNA üksikahelaliste katkete teket ning kõrvaldab DNA-st ühe superspiraali.984Sõnastik
Ensüüm, mis põhjustab DNA kaksikahelaliste katkete teket ning mis kõrvaldab või tekitab ühe sündmusena kaks superspiraali. Vt. DNA güraas.
Ensüüm, mis põhjustab võõr-DNA imbumise rakku läbi rakumembraanikanali tänu seondumisele kanali valkudega.
DNA polümeraas libiseb mööda kordusi tagasi ja initsieerib korduvalt uute DNA trinukleotiidide sünteesi. Vt. DNA polümeraasi libisemine.
Vt. DNA-selgroog.
DNA-molekuli üks ahel paardub temaga rekombineeruvast molekulist pärit komplementaarse DNA-ahelaga.
Vt. fotoreaktivatsioon.
3´ → 5´ suunas orienteeritud DNA-viivisahelaga (matriitsahelaga) määratud süntees tagasisuunaliste 5´ → 3´ Okazaki fragmentidena. Vt. Okazaki fragment.
5´ → 3´ suunas pikeneva DNA-ahela pidev süntees 3´ → 5´ suunas orienteeritud matriitsahelalt.
Krossingoveri esimeses etapis viib RecA-valk DNA kaksikheeliksis läbi retsiprookseid DNA-ahelate asendamisi. Nimelt, DNA-molekuli üks üksikahel paardub esmalt teise DNA-molekuli komplementaarse üksikahelaga, jättes mõlemas molekulis üksikuks… Read More »DNA-ahelate asendamine (ingl. Strand replacement)
DNA ühinemisel regulatoorsete valkudega muutub tema tavastruktuur, st. ahelad painduvad. Ahelate paindumine võimaldab DNA-l eksponeerida kindlaid nukleotiitseid järjestusi.
Krosssingoveri teises etapis DNA-ahelate asendamisele järgnevalt paardub üksikuks jäänud ahel talle komplementaarse esimesest DNA-molekulist pärit üksikahelalise piirkonnaga.
DNA-klonoteegi kloonides esinev organismi kogu genoomne DNA e. organismi genoomiraamatukogu.
Nukleotiidijääkide omavaheline järjestus DNA-ahelates.
Tänapäevaste DNA-järjestuste tagasiviimine eellasjärjestusteni, mis esinevad ühiseellastel ning kus kahe isendi DNA liitub üheks ühiseks järjestuseks. Sellel ajalisel skaalal sedastub mutatsioonide arv.
Transkriptsiooni aktivatsiooni mehhanism. Näiteks on lac-promootori CRP-DNA-kompleks DNA enda sünteesitelje suhtes 90o käändu-nud.
Kloonide kogum organismi genoomiraamatukogus, mis katab kogu genoomse DNA.
Ahel, millel toimub DNA pidev replikatsioon.
Kromosoomilingud. Kokku pakitud kromosoomi lahtikeerdunud lingukujulised osad. Vt. juuksenõelastruktuurid; lambiharikromosoomid.
DNA võimendajate ja promootorelementide kokkuviimisel RNA polümeraasiga moodustuvad nendevahelised ühendkompleksid, mistõttu DNA voltub, sest DNA võimendaja ja promootorpiirkondade vahele jäävast alast moodustub DNA ling. Vt.… Read More »DNA-looked (ingl. DNA folding)
Mõneruutsentimeetrilisele kandjale (nt. alusklaas) laikudena kovalentselt kinnitatud kümned tuhanded spetsiifilised oligonukleotiidsed DNA-proovid.
Molekulaarbioloogias kasutatav multiplekstehnoloogia, kus tahkele kandjale (klaas, silikon Affymetrix-kiipidel või kuulikestele Illumina platformil) kovalentselt kinnitatud kümneid tuhandeid spetsiifilisi oligonukleotiidseid järjestusi hübriiditakse spetsiifiliste cDNA- või cRNA-proovidega.
Erinevate geograafiliste isolaatide ja inbriidsete liinide eripärased RFLP-mustrid. Vt. RFLP.
Vt. DNA-genoteek.
Kaksikahelaline nukleiinhape, kus üheks ahelaks on DNA, teiseks ahelaks sellele komplementaarne RNA.
Desoksüriboosi- ja fosfaatjääkide monotoonne järgnevus DNA ahelates.
DNA otstega ühenduv ensüüm.
Uuritav huvipakkuvate järjestustega radioaktiivne DNA-proov, mis hübriiditakse membraanile kinnistatud DNA-le.
Restriktaasidega katkilõigatud ja komplementaarse(te) nukleiinhappe proovi(de)ga hübriiditud individuaalse genoomse DNA southern-bloti vöötsuse muster, mis on indiviidispetsiifiline.
Ahel, millel toimub replikatsioonikahvlist tagasisuunaline DNA katkendlik süntees Okazaki fragmentidena.
Vt. southern-ülekanne.
Vt. pankrease desoksüribonukleaas I.
Transkriptsiooni alustamisel lokaalselt lahtikeerdunud DNA-lõigud.